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日本微软于11月27日发表了该公司针对开放源码的方针与看法，这是针对朝日新闻11月16日的晚刊及朝日新闻网站上报道的《电子政府OS脱离Windows、倾向开放源码》进行的反驳。这篇文章可概括为5条，分别与朝日新闻的报道逐一对应。
●“为提高‘电子政府’的安全性，日本政府开始重新审视操作系统。很有可能更换目前占据大半份额的Windows”(引号内是本刊对朝日新闻报道的概括。以下同)。日本微软则认为，对于“e-Japan计划”，日本微软也是公司上下一致表示赞同，而且正根据政府各省厅及各自治体规定的方针积极进行有关公开源码的研讨。
●对于朝日新闻提出的“日本微软的Windows不是开放源码的操作系统”，微软文章反驳称，日本微软已经认识到开放源码的价值，通过该公司的“共享源码计划(SSI)”合同，已经公开了源码。
●对于“自民党因安全原因希望政府推进开放源码操作系统的导入”，文章认为有调查结果显示，开放源码软件与商用软件相比在安全方面未必优秀，作为论据，还指出Windows 2000已经取得了ISO 15408(安全评价通用标准认证)。
●对于“使用者无需支付授权费用，也可以更改程序，在出现问题时系统管理很方便”，文章虽然没有直接反驳称，但表示开放源码的操作系统尽管导入费用低，但在维护成本及公司内部人事费用等TCO(Total Cost of Ownership)方面却远远高于Windows。
●对于三菱综合研究所主任研究员发表的“政府导入开放源码操作系统可以扶植国内相关产业”的评论，文章认为，许多开放源码软件采用的授权规定“GPL(General Public License)”允许免费发布与修改，但这反而会成为国内软件产业发展的制约因素。
在朝日新闻的报道最初出台时，一些系统集成业界人士表示，“什么都不懂的政府人士可能被部分狂热片面的专家欺骗了。虽说是公开了源码，但未必就能提高安全性”，对文章的内容提出了质疑。并指出目前已有多个项目正在导入Windows系统。
除朝日新闻外，北海道新闻也登出了同样的报道，日本微软认为“社会影响巨大”，正考虑如何反驳。对于此次反驳的内容，该公司宣传部同时表示：“并非是因为朝日新闻登出了文章，我们才开始考虑向公开源码的方向转变的。但也并不是说我们对开放源码采取否定态度。本来，‘非公开源码不可’的这种观点的出发点就可笑之极”，对于随后部分报道称“日本微软转变方针”，他们反驳道：“此次的发表的文章只是将日本微软一年半前发表的《共享源码计划》里的内容重新归纳整理了一遍，根本没什么新内容。但对于一直不为人所知的《共享源码计划》，今后将积极向社会宣传，这一点可以说是方针转变吧”。
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