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实际上，在以上的方法中存在着一个致命的缺点，那就是：如果用户刚刚感染CIH病毒，那么这样一个大面积的搜索过程实际上也是在扩大病毒的感染面。一般情况下，推荐的方法是先运行一下“写字板”软件，然后使用上面的方法在“写字板”软件的可执行程序Notepade.exe中搜索特征串，以判断是否感染了CIH病毒。
另外一个判断方法是在Windows PE文件中搜索IMAGE_NT_SIGNATURE字段，也就是0x00004550，其代表的识别字符为“PE00”，然后查看其前一个字节是否为0x00，如果是，则表示程序未受感染，如果为其他数值，则表示很可能已经感染了CIH病毒。
最后一个判断方法是先搜索IMAGE_NT_SIGNATURE字段--“PE00”，接着搜索其偏移0x28位置处的值是否为55 8D 44 24 F8 33 DB 64，如果是，则表示此程序已被感染。
还听说凡是感染了CIH病毒的机器，如果玩NEED FOR SPEED II游戏时，会在读取游戏光盘时出现死机现象， 本人没有尝试过，不知道实际上是不是有这一情况存在。
适合高级用户使用的一个方法是直接搜索特征代码，并将其修改掉，方法是：先处理掉两个转跳点，即搜索：5E CC 56 8B F0 特征串以及5E CC FB 33 DB特征串，将这两个特征串中的CC改90(nop)，接着搜索 CD 20 53 00 01 00 83 C4 20 与 CD 20 67 00 40 00特征字串，将其全部修改为90，即可（以上数值全部为16进制）。
另外一种方法是将原先的PE程序的正确入口点找回来，填入当前入口点即可（此处以一个被感染的CALC.EXE程序为例），具体方法为：先搜IMAGE_NT_SIGNATURE字段--“PE00”，接着将距此点偏移0x28处的4个字节值，例如“A0 02 00 00”(0x000002A0)，再由此偏移所指的位置（即0x02A0）找到数据“55 8D 44 24 F8 33 DB 64”， 并由0X02A0加上0X005E得到0x02FE偏移，此偏移处的数据例如为“CB 21 40 00”（OXOO4021CB），将此值减去OX40000，将得数--“CB 21 00 00”（OXOO0021CB）值放回到距“PE00”点偏移0x28的位置即可（此处为Windows PE格式程序的入口点，术语称为Program Entry Point）。最后将“55 8D 44 24 F8 33 DB 64”全部填成“00”，使得我们容易判断病毒是否已经被杀除过。
按照上面手工杀毒的方法一般适合于某些单独的软件（例如某些软件包含在软盘中，却被感染了CIH不读，可现在就要用，呵呵！）。使用上述方法的缺点在于病毒体还将保留在可执行文件中，虽然不会起作用， 但是想起来可能会有点不舒服（记得“WPS2000测试版残留CIH病毒尸体”的事件么？）。所以，想彻底杀灭，推荐使用某些反病毒软件进行或是CIH专用杀毒工具（以上操作以及使用反病毒软件进行杀毒，必须使用干净的系统盘启动计算机）。
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